L’itinéraire de cyclotourisme de la Grande Traversée des Montagnes du Jura a vu le jour en 2006.

Le parcours, accessible en train, totalise 360 km entre la ville de Montbéliard (Doubs) au nord et Culoz (Ain) au sud, en passant par : Morteau, Pontarlier, Mouthe, Morez et Bellegarde-sur-Valserine. Il traverse le Parc naturel régional du Haut-Jura.

Cet itinéraire propose également 3 variantes qui permettent de franchir un col ou de découvrir une curiosité des Montagnes du Jura.

Il est actuellement balisé dans le département de l'Ain (entre Mijoux et Culoz) et, dès le printemps 2013 dans celui du Jura (entre Foncine-le-Haut et Lajoux), uniquement dans le sens Nord/Sud ; une signalétique sera ensuite mise en place dans le Doubs,